产品简介 Product Introduction


    全转录组测序能够获得特定组织或细胞在特定状态下的转录本总和,包括mRNA和非编码RNA(ncRNA)。其中,目前研究比较热门的ncRNA包括miRNA、lncRNA和circRNA。以miRNA为中心,构建具有相互调控作用的MRE元件(MiRNA Response Element),形成ceRNA(mRNA-miRNA-lncRNA-circRNA)调控网络,从而揭示样本中转录调控的生物学机制。


分析流程  Analysis Process

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测序策略  Sequencing Strategy


一份样本,两个文库1)采用去核糖体链特异性建库模式,进行PE150测序,16G clean data数据量;(2)采用富集小RNA片段建库模式,进行SE150测序,10M reads数据量。得到四种RNA,全面解析转录调控机制


分析内容  Analysis Content


1)lncRNA与mRNA关联分析;

2)lncRNA与miRNA关联分析;

3)miRNA与mRNA关联分析;

4)lncRNA、miRNA与mRNA关联分析;

5)circRNA与miRNA关联分析;

6)circRNA、miRNA与mRNA关联分析;

7)全局展示所有RNA分析。



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