产品简介 Product Introduction
基因组调研图(Genome Survey Analysis)是一种基于二代测序数据的初步基因组分析方法,主要用于评估基因组的基本特征,如基因组大小、杂合度、重复序列比例和GC含量等。它是基因组学研究的重要步骤,为后续的全基因组测序和组装提供关键参考信息。
分析流程 Analysis process
测序策略 sequencing strategy
物种分类 | 测序平台 | 测序深度 | 备注 |
简单物种 | Illumina或者BGI | 50X | 二倍体 |
多倍体 | Illumina或者BGI | 70-100X | 多倍体等复杂物种 |
分析内容 Analysis content
(1) 绘制kmer分布图;
(2) 评估基因组大小;
(3) 评估基因组杂合情况;
(4) 评估重复序列比例;
(5) 评估基因组GC含量;
(6) 评估样品是否有外缘污染;
(7) 评估样品中细胞器DNA含量;
津ICP备2025029719号-1
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