产品简介 Product Introduction


  基因组调研图(Genome Survey Analysis)是一种基于二代测序数据的初步基因组分析方法,主要用于评估基因组的基本特征,如基因组大小、杂合度、重复序列比例和GC含量等。它是基因组学研究的重要步骤,为后续的全基因组测序和组装提供关键参考信息。

 

分析流程  Analysis process


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测序策略  sequencing strategy


物种分类

测序平台

测序深度

备注

简单物种

Illumina或者BGI

50X

二倍体

多倍体

Illumina或者BGI

70-100X

多倍体等复杂物种





 

分析内容  Analysis content


(1) 绘制kmer分布图;

(2) 评估基因组大小;

(3) 评估基因组杂合情况;

(4) 评估重复序列比例

(5) 评估基因组GC含量;

(6) 评估样品是否有外缘污染;

(7) 评估样品中细胞器DNA含量;


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