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染色体水平甲基化分布图

样品间功能区域甲基化水平聚类热图

样品DMR注释结果

WGBS和RNA-seq揭示温度诱导的表观遗传调控对沟鲶性别分化的影响

文章题目：5 mC modiffcation of steroid hormone biosynthesis-related genes orchestrates feminization of channel catffsh induced by high-temperature

发表时间：2024年6月

发表期刊：Environmental Pollution

组学技术：WGBS、RNA-seq

研究结果：

为了探讨沟鲶在高温环境下雌性化的机制，本研究中，进行了全面的转录组和全基因组甲基化测序分析，通过KEGG通路和GO富集分析识别出野生型雌鱼和XY假雌鱼间的差异甲基化基因，特别强调了srd5a2基因内的多个差异甲基化位点。重复测试确认了XY假雌鱼中srd5a2有7个独特甲基化位点，其中一个（16608174）能区分XY假雌鱼与正常雌鱼。研究使用了WGBS分析甲基化与性别分化的关系。结果显示，每个样本平均产生27.5Gb数据，覆盖率达30×，超过6.79%的胞嘧啶发生转换，其中mCG是最主要的甲基化类型（占比98.02%-98.50%）。mCG甲基化不仅是样本中的主要甲基化类型，在沟鲶29条染色体上也占据主导地位。

高温诱导组（T）与对照组（C）三种甲基化水平比较的Circos图

基因功能区域的差异甲基化水平

C组和T组srd5a2基因差异甲基化位点的详细显示

参考文献：

Xu S, et al. 5mC modification of steroid hormone biosynthesis-related genes orchestrates feminization of channel catfish induced by high-temperature. Environmental Pollution. 2024.