产品简介 Product Introduction


    宏基因组学(Metagenomics),是以特定生境中的整个微生物群落作为研究对象,无需分离培养,直接提取环境样本DNA进行测序,研究环境微生物的群落结构、物种分类、系统进化、基因功能及代谢网络等,已广泛应用于微生物领域。


分析流程  Analysis Process

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测序策略  Sequencing Strategy

    

测序平台

数据量推荐

样本类型

二代illumina/BGI

6-12G clean data/样

粪便、肠道内容物、

土壤、水体、唾液等


分析内容  Analysis Content


1)测序数据质量评估;

2)基因预测;

3)物种、功能注释((Nr、Go、KEGG、eggNOG、Pfam、SwissProt、CAZy、CARD、PHI-base、CYPED));

4)碳氮硫循环分析;

5)噬菌体分析;

6)binning+单菌组装;

7)CCA/RDA 分析。



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